Han transcurrido cuatro años desde la destrucción del Parque Jurásico, y el Dr. Malcolm está a punto de descubrir que algo ha logrado sobrevivir. En una isla de Costa Rica que forma parte de la Costa de las Cinco Muertes, los dinosaurios habitan y se reproducen en estado salvaje. Este es el área conocida como zona B: el sitio que funcionaba como laboratorio de genética. Tras la quiebra de la empresa causada por John Hammond, su sobrino Peter ha asumido el control y está decidido a reiniciar la compañía aprovechando los riesgos de esta peligrosa zona.